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NAVRATIL VINCENT
training-prabi
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19425355
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19425355
authored
Dec 09, 2021
by
NAVRATIL VINCENT
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@@ -28,13 +28,13 @@ Adil El Filali (LBBE)
-
12 avril 14h : Expressions régulières (SP)
-
27 avril 11h : Programmation en bash (VP)
-
1er avril 14h :
**Initiation à bioconda**
(Intervenant :
?
)
-
1er avril 14h :
**Initiation à bioconda**
(Intervenant :
SD
)
-
6 avril 13h30 :
**Utilisation du cloud**
(Intervenant: SD)
-
21 Octobre 2021 :
**Pour une utilisation maîtrisée et raisonnée des ressources de calcul au laboratoire**
(Intervenants: BS, SD)
-
21 Octobre 2021 :
**Pour une utilisation maîtrisée et raisonnée des ressources de calcul au laboratoire**
(Intervenants
: BS, SD)
-
29 Novembre 2021 (13h30-15h) :
**Initiation à l'alignement de séquences/recherche de similarités à l'aide de BLAST**
(Intervenant: DG, support: VN)
-
6 Décembre 2021 (13h30-15h, 15h-16h30 BYOD):
**Initiation à la phylogénie moléculaire à l'aide de Seaview 5**
(Intervenant: GP, support: DG, VN)
-
13 Décembre 2021 (13h30-14h30; 14h30-15h30 BYOD) :
**Initiation à l'utilisation d'iRODS à travers easicmd**
(Intervenant : GD ,support: DG, VN)
-
6 Décembre 2021 (13h30-15h, 15h-16h30 BYOD):
**Initiation à la phylogénie moléculaire à l'aide de Seaview 5**
(Intervenant
: GP, support
: DG, VN)
-
13 Décembre 2021 (13h30-14h30; 14h30-15h30 BYOD) :
**Initiation à l'utilisation d'iRODS à travers easicmd**
(Intervenant : GD ,
support
: DG, VN)
https://github.com/sigau/easy_irods_commands
...
...
@@ -42,6 +42,9 @@ https://github.com/sigau/easy_irods_commands
Possibilité d'organiser une rencontre avec les utilisateurs en début d'année pour des idées. Implication des étudiants/doctorants ?
Idée de suivre le livre biostar handbook (https://www.biostarhandbook.com/): 100h un chapitre/partie par semaine à lire; pratique en atelier.
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Mapping de lectures -> DESeq (Christine Oger)
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Base calling Nanopore / Assemblage de novo (?)
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Prise en main de paraload (Dominique Guyot)
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