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handson-rstudio/README.md

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 ![Getting started with RStudio](https://learning.oreilly.com/library/cover/9781449314798/250w/)
 
 ## Qu'est ce que R ?
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 - un environnement logiciel open-source pour les calculs scientifiques et les graphiques.
 - disponibles pour Windows, Mac OS X et plusieurs plateformes UNIX (incluant Linux) sous forme de binaires (compilés)
 - Robert Gentleman and Ross Ihaka et la R’s core development team
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 - the Comprehensive R Archive Network (CRAN) http://cran.r-project.org
 
 ## Pourquoi utiliser l'IDE RStudio ?
+
 - IDE (Integrated Development Environnment)
 - projet open-source, multi-plateformes (Windows, Mac Os X, UNIX)
 - mode standalone () ou serveur (à travers un naviguateur web)
@@ -45,8 +47,8 @@ https://rstudio.com/products/rstudio/download/#download
 > - Le programme R est lancé dans le répertoire courant (**working directory** - wd)
 > - Si présentes, les commandes dans le fichier **.Rprofile** sont executées
 > - Si présentes les données dans le fichier **.Rdata** sont chargées
-> - En quitant (à l'aide de la commande **quit()**), l'utilisateur peut sauvegarder son espace de travail en répondant "yes" à la question "Save workspace image ?" (les données stockées dans les **objets R** seront écrites dans le **.RData**, les commandes dans le fichier **.Rhistory**)
-> - Il y a la possibilité d'utiliser la commande **save.image()** ou **save()**en cours de session pour sauveguarder respectivement tout ou une partie des objets de la session dans un fichier au foramt .RData. Il y a la possibilité de recharger ce fichier à l'aide de la fonction **load()**
+> - En quitant (à l'aide de la commande `quit()`), l'utilisateur peut sauvegarder son espace de travail en répondant "yes" à la question "Save workspace image ?" (les données stockées dans les **objets R** seront écrites dans le **.RData**, les commandes dans le fichier **.Rhistory**)
+> - Il y a la possibilité d'utiliser la commande `save.image()` ou `save()` en cours de session pour sauveguarder respectivement tout ou une partie des objets de la session dans un fichier au foramt **.RDat**. Il y a la possibilité de recharger ce fichier à l'aide de la fonction `load()`
 
 ### Notion de Projets sous RStudio
 
@@ -57,7 +59,7 @@ Les nouveaux projets sont de plusieurs types (Analyse : **"New Project"**, Déve
 - Possibilité d'utiliser un gestionnaire de package **Packrat** ("Use packrat with this project") http://rstudio.github.io/packrat/rstudio.html
 
 > ### Astuce
-> Utiliser la variable d'environnement **RSTUDIO_WHICH_R** afin de  pointer sur une version de R donnée
+> Utiliser la variable d'environnement `RSTUDIO_WHICH_R` afin de  pointer sur une version de R donnée.
 ```bash
 export RSTUDIO_WHICH_R=/usr/local/bin/R
 ```
@@ -80,3 +82,8 @@ swirl()
 
 ## Pour aller plus loin 
 R For Data Science: https://r4ds.had.co.nz/index.html
+
+## Prochains thèmes
+Initiation à Bioconductor
+Initiation à tidyverse
+...