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NAVRATIL VINCENT
training-prabi
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9c6bc789
Commit
9c6bc789
authored
Jan 08, 2022
by
NAVRATIL VINCENT
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handson-rstudio/README.md
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9c6bc789
...
...
@@ -11,6 +11,14 @@ author: Vincent Navratil (vincent.navratil@univ-lyon1.fr)
-
pas de connaissance de base sur les lignes de commandes et R
# Pour les fayots qui veulent prendre de l'avance !
https://software-carpentry.org/lessons/index.html
https://swcarpentry.github.io/r-novice-gapminder/
http://swcarpentry.github.io/r-novice-inflammation/
# Séance 1 - Prise en main de l'IDE RStudio
## Objectif de l'atelier
...
...
@@ -28,8 +36,9 @@ author: Vincent Navratil (vincent.navratil@univ-lyon1.fr)
-
un environnement logiciel open-source pour les calculs scientifiques et les graphiques.
-
disponibles pour Windows, Mac OS X et plusieurs plateformes UNIX (incluant Linux) sous forme de binaires (compilés)
-
Robert Gentleman and Ross Ihaka et la R’s core development team
-
un langage de programmation (de script) interprété + add-on package
-
un langage de programmation (de script) interprété + add-on package
(13000)
-
the Comprehensive R Archive Network (CRAN) http://cran.r-project.org
-
un souffle nouveau avec l'univers tidyverse de la team RStudio et de la pédagogie tidyverse first.
## Pourquoi utiliser l'IDE RStudio ?
...
...
@@ -85,7 +94,8 @@ Les nouveaux projets sont de plusieurs types (Analyse : **"New Project"**, Déve
En cliquant sur l'onglet RStudio>preferences nous avons accès aux options paramétrables de RStudio.
## Quelques cours en ligne utiles
## Quelques cours en ligne utiles
https://biostat2.uni.lu/lectures.html
http://perso.ens-lyon.fr/lise.vaudor/grimoire/
...
...
@@ -105,7 +115,8 @@ https://raw.githubusercontent.com/rstudio/cheatsheets/master/rstudio-ide.pdf
Le
**package base**
de R est constitué d'un ensemble de fonctions et de données installés par défaut.
Nous allons utiliser le jeux de données
`iris`
pour illustrer les différentes fonctionalités de base de R.
Nous allons utiliser le jeux de données des Iris de Fisher
`iris`
pour illustrer les différentes fonctionalités de base de R.
https://fr.wikipedia.org/wiki/Iris_de_Fisher
<img
src=
"https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/56/Kosaciec_szczecinkowaty_Iris_setosa.jpg/440px-Kosaciec_szczecinkowaty_Iris_setosa.jpg"
width=
"100px"
>
<i>
Iris setosa
</i><br>
...
...
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