Commit 9c6bc789 authored by NAVRATIL VINCENT's avatar NAVRATIL VINCENT
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......@@ -11,6 +11,14 @@ author: Vincent Navratil (vincent.navratil@univ-lyon1.fr)
- pas de connaissance de base sur les lignes de commandes et R
# Pour les fayots qui veulent prendre de l'avance !
https://software-carpentry.org/lessons/index.html
https://swcarpentry.github.io/r-novice-gapminder/
http://swcarpentry.github.io/r-novice-inflammation/
# Séance 1 - Prise en main de l'IDE RStudio
## Objectif de l'atelier
......@@ -28,8 +36,9 @@ author: Vincent Navratil (vincent.navratil@univ-lyon1.fr)
- un environnement logiciel open-source pour les calculs scientifiques et les graphiques.
- disponibles pour Windows, Mac OS X et plusieurs plateformes UNIX (incluant Linux) sous forme de binaires (compilés)
- Robert Gentleman and Ross Ihaka et la R’s core development team
- un langage de programmation (de script) interprété + add-on package
- un langage de programmation (de script) interprété + add-on package (13000)
- the Comprehensive R Archive Network (CRAN) http://cran.r-project.org
- un souffle nouveau avec l'univers tidyverse de la team RStudio et de la pédagogie tidyverse first.
## Pourquoi utiliser l'IDE RStudio ?
......@@ -85,7 +94,8 @@ Les nouveaux projets sont de plusieurs types (Analyse : **"New Project"**, Déve
En cliquant sur l'onglet RStudio>preferences nous avons accès aux options paramétrables de RStudio.
## Quelques cours en ligne utiles
## Quelques cours en ligne utiles
https://biostat2.uni.lu/lectures.html
http://perso.ens-lyon.fr/lise.vaudor/grimoire/
......@@ -105,7 +115,8 @@ https://raw.githubusercontent.com/rstudio/cheatsheets/master/rstudio-ide.pdf
Le **package base** de R est constitué d'un ensemble de fonctions et de données installés par défaut.
Nous allons utiliser le jeux de données `iris` pour illustrer les différentes fonctionalités de base de R.
Nous allons utiliser le jeux de données des Iris de Fisher `iris` pour illustrer les différentes fonctionalités de base de R.
https://fr.wikipedia.org/wiki/Iris_de_Fisher
<img src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/56/Kosaciec_szczecinkowaty_Iris_setosa.jpg/440px-Kosaciec_szczecinkowaty_Iris_setosa.jpg" width="100px"> <i>Iris setosa</i><br>
......
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