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......@@ -4,16 +4,17 @@ BYOD (Bring Your Own Data)
## Calendrier des Ateliers informatiques/bioinformatiques du LBBE/ PRABI-amsb (FR BioEEnvis) 2021-2022:
Bruno Spataro (LBBE)
Stéphane Delmotte (LBBE)
Philippe Veber (LBBE)
Dominique Guyot (PRABI-amsb)
Simon Penel (LBBE)
Vincent Navratil (PRABI-amsb)
Guy Perrière LBBE
Christine Oger (PRABI-amsb)
Gautier Debaecker (LEHNA)
Adil El Filali (LBBE)
- Bruno Spataro (LBBE)
- Stéphane Delmotte (LBBE)
- Philippe Veber (LBBE)
- Dominique Guyot (PRABI-amsb)
- Simon Penel (LBBE)
- Vincent Navratil (PRABI-amsb)
- Guy Perrière LBBE
- Christine Oger (PRABI-amsb)
- Gautier Debaecker (LEHNA)
- Adil El Filali (LBBE)
- 26 Janvier 2021 : **Pour une utilisation maîtrisée et raisonnée des ressources de calcul au laboratoire** (Intervenants: BS, SD)
- 11 mars au 06 avril 2021 : **Initiation à la ligne de commande Linux** (Intervenants: PV, BS, DG, SP) https://pveber.pages.in2p3.fr/ateliers-pi/ligne-de-commande.htm
......@@ -45,16 +46,17 @@ Possibilité d'organiser une rencontre avec les utilisateurs/étudiants en débu
Idée de suivre le livre biostar handbook (https://www.biostarhandbook.com/): 100h un chapitre/partie par semaine à lire; pratique en atelier.
- Mapping de lectures -> DESeq (Christine Oger)
- Base calling Nanopore / Assemblage de novo (?)
- Prise en main de paraload (Dominique Guyot)
- Assemblage de Novo RNA-seq Trinity (Vincent Navratil) - targeted gene assembly
- Initiation à R à travers Rstudio (Vincent Navratil) : comme ça ça m'apprend à utiliser un peu RStudio :-)
- Initiation au développement d'application Shiny par les nuls (Vincent Navratil) 1h30
- Prise en main de l'interface web Hogenom (Simon Penel) -> Banque à façon plus expert ?
- Docker (Adil Elfilali, Stéphane Delmotte)
- [ ] - Mapping de lectures -> DESeq (Christine Oger)
- [ ] - Base calling Nanopore / Assemblage de novo (?)
- [ ] - Prise en main de paraload (Dominique Guyot)
- [ ] - Assemblage de Novo RNA-seq Trinity (Vincent Navratil) - targeted gene assembly
- [ ] - Initiation à R à travers Rstudio (Vincent Navratil) : comme ça ça m'apprend à utiliser un peu RStudio :-)
- [ ] - Initiation au développement d'application Shiny par les nuls (Vincent Navratil) 1h30
- [ ] - Prise en main de l'interface web Hogenom (Simon Penel) -> Banque à façon plus expert ?
- [ ]
- [ ] - Docker (Adil Elfilali, Stéphane Delmotte)
- [ ]
- [ ] - Invitation en fonction de la crise sanitaire (Metexplore etc...)
- Invitation en fonction de la crise sanitaire (Metexplore etc...)
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