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Idée de suivre le livre biostar handbook (https://www.biostarhandbook.com/): 100h un chapitre/partie par semaine à lire; pratique en atelier.
- [ ] - Mapping de lectures -> DESeq (Christine Oger)
- [ ] - Base calling Nanopore / Assemblage de novo (?)
- [ ] - Prise en main de paraload (Dominique Guyot)
- [ ] - Assemblage de Novo RNA-seq Trinity (Vincent Navratil) - targeted gene assembly
- [ ] - Initiation à R à travers Rstudio (Vincent Navratil) : comme ça ça m'apprend à utiliser un peu RStudio :-)
- [ ] - Initiation au développement d'application Shiny par les nuls (Vincent Navratil) 1h30
- [ ] - Prise en main de l'interface web Hogenom (Simon Penel) -> Banque à façon plus expert ?
- [ ]
- [ ] - Docker (Adil Elfilali, Stéphane Delmotte)
- [ ]
- [ ] - Invitation en fonction de la crise sanitaire (Metexplore etc...)
- Mapping de lectures -> DESeq (Christine Oger)
- Base calling Nanopore / Assemblage de novo (?)
- Prise en main de paraload (Dominique Guyot)
- Assemblage de Novo RNA-seq Trinity (Vincent Navratil) - targeted gene assembly
- Initiation à R à travers Rstudio (Vincent Navratil) : comme ça ça m'apprend à utiliser un peu RStudio :-)
- Initiation au développement d'application Shiny par les nuls (Vincent Navratil) 1h30
- Prise en main de l'interface web Hogenom (Simon Penel) -> Banque à façon plus expert ?
- Docker/Singularity (Adil Elfilali, Stéphane Delmotte)
- Invitation en fonction de la crise sanitaire (Metexplore etc...)
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