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......@@ -48,18 +48,27 @@ Possibilité d'organiser une rencontre avec les utilisateurs/étudiants en débu
- Idée de suivre le livre biostar handbook (https://www.biostarhandbook.com/): 100h un chapitre/partie par semaine à lire; pratique en atelier.
- Se baser sur le matériel des galaxy training
- Utiliser le matériel des galaxy training ?
Niveau Ewok
- Prise en main de paraload (Dominique Guyot)
- Initiation à R à travers Rstudio (Vincent Navratil) : comme ça ça m'apprend à utiliser un peu RStudio :-)
- Prise en main de l'interface web Hogenom (Simon Penel) -> Banque à façon plus expert ?
Niveau Padawan
- Mapping de lectures -> DESeq (Christine Oger)
- Base calling Nanopore / Assemblage de novo (Christine Oger)
- Prise en main de paraload (Dominique Guyot)
- Assemblage de Novo RNA-seq Trinity (Vincent Navratil) - targeted gene assembly
- Initiation à R à travers Rstudio (Vincent Navratil) : comme ça ça m'apprend à utiliser un peu RStudio :-)
- Initiation à Cytoscape (Vincent Navratil, DG ?) 1h30
Niveaux Jedi (Inspiré de South Green)
- Docker/Singularity (Adil Elfilali, Stéphane Delmotte)
- Initiation au développement d'application Shiny par les nuls (Vincent Navratil) 1h30
- Prise en main de l'interface web Hogenom (Simon Penel) -> Banque à façon plus expert ?
- Prise en main de paraload (Dominique Guyot)
- Docker/Singularity (Adil Elfilali, Stéphane Delmotte)
- Invitation en fonction de la crise sanitaire :
(Metexplore etc...)
......
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