Impossibilité d'installer un package
Bonjour,
J'essaie d'utiliser le fichier install.R. Ici je teste simplement l'installation de ggplot2 qui est par défaut déjà installation puisque l'instannce est rocker/shiny-verse si j'ai bien compris. Néanmoins, j'ai l'erreur suivante. Il semblerait qu'il y ait un problème d'accès au dépôt des packages binaires, ie https://packagemanager.posit.co/cran/linux/jammy/latest/src/contrib/PACKAGES. Si je teste avec mon browser web, cette page s'affiche bien.
J'utilise l'instance shiny et je pointe vers mon dépôt de test https://gitcrcm.marseille.inserm.fr/granjeaud/shiny_ifb.git
Cordialement, Samuel
Edit 1: l'erreur est observée sur prabi-girofle, mais pas sur core-cloudbis... Je n'ai pas trouvé d'indication du cloud dans le rapport d'installation d'une VM.
#10 [6/6] RUN if [ -f "install.R" ]; then Rscript install.R; fi
#10 0.799 Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
#10 0.799 (as ‘lib’ is unspecified)
: 2023-10-24T10:56:12Z : Contacting the server with GET, at: https://slipstream.france-bioinformatique.fr/run/da086123-7ade-4297-8772-9d2b4b91afe5/ss:abort?ignoreabort=true
: 2023-10-24T10:56:43Z : Contacting the server with GET, at: https://slipstream.france-bioinformatique.fr/run/da086123-7ade-4297-8772-9d2b4b91afe5/ss:abort?ignoreabort=true
: 2023-10-24T10:57:13Z : Contacting the server with GET, at: https://slipstream.france-bioinformatique.fr/run/da086123-7ade-4297-8772-9d2b4b91afe5/ss:abort?ignoreabort=true
: 2023-10-24T10:57:43Z : Contacting the server with GET, at: https://slipstream.france-bioinformatique.fr/run/da086123-7ade-4297-8772-9d2b4b91afe5/ss:abort?ignoreabort=true
: 2023-10-24T10:58:13Z : Contacting the server with GET, at: https://slipstream.france-bioinformatique.fr/run/da086123-7ade-4297-8772-9d2b4b91afe5/ss:abort?ignoreabort=true
: 2023-10-24T10:58:43Z : Contacting the server with GET, at: https://slipstream.france-bioinformatique.fr/run/da086123-7ade-4297-8772-9d2b4b91afe5/ss:abort?ignoreabort=true
#10 181.1 Warning: unable to access index for repository https://packagemanager.posit.co/cran/__linux__/jammy/latest/src/contrib:
#10 181.1 cannot open URL 'https://packagemanager.posit.co/cran/__linux__/jammy/latest/src/contrib/PACKAGES'
#10 181.1 Warning message:
#10 181.1 package ‘ggplot2’ is not available for this version of R
#10 181.1
#10 181.1 A version of this package for your version of R might be available elsewhere,
#10 181.1 see the ideas at
#10 181.1 https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages
#10 DONE 181.3s