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import os
import subprocess
# Lire le répertoire d'entrée depuis les arguments de configuration
#input_directory = config["folder"]
input_directory = "/home/morfouacep/Physics/ganil/pista/analysisenv-e850-2023/np_raw/part1"
origin = []
# Iterate over files in input_directory
for filename in os.listdir(input_directory):
f = os.path.join(input_directory, filename)
if f.endswith(".root"):
origin.append(filename)
# Définir le répertoire de sortie pour les fichiers convertis
phy_directory = "/home/morfouacep/Physics/NPTool/nptool/Projects/ana_e850/root/analysis"
#phy_directory = "./"
# define target files directory
analysedfile = []
for inputfile in origin:
#analysedfile.append("/home/morfouacep/Physics/NPTool/nptool/Projects/ana_e850/root/analysis/"+inputfile.replace("_raw_","_"))
analysedfile.append("/home/morfouacep/Physics/NPTool/nptool/Projects/ana_e850/root/analysis/"+inputfile)
## batch rules
rule all:
input:
expand("{file}",file=analysedfile)
# Règle pour convertir les fichiers .fast dans le dossier .cat en .root
rule npanalysis:
input:
f"{input_directory}/{{name}}.root"
output:
f"{phy_directory}/{{name}}.root"
shell:
"npanalysis -T {input} RawTree -C Calibration_part1.txt -D pista_e850_part1.detector -O {output}"